Hallo Rob,
der Auto-Import hat einige Probleme, etwa mit Sonderzeichen o. Ä. - hatte das vor ein paar Monaten auch mal, manche Emails wurden nicht importiert.
Schau mal, ob du in der suitecrm.log Datei Hinweise findest.
Was passiert denn, wenn du die cron Datei manuell ausführst (nachdem eine E-Mail in der INBOX liegt)?
cd /dein_suitecrm_installationspfad/public/legacy
php sudo -u www-data -f cron.php
Zu der BCC Situation:
Es gibt einige Erweiterungen und Projekte, die genau das machen - man muss da nicht unbedingt die Suite Standard Funktionalität nehmen (was bei BCC wohl nicht (mehr?) funktioniert).
Ein Bsp: GitHub - blak3r/email-to-sugar: Email Archiving for SugarCRM
Und ein weiterer Thread: BCC Email Dropbox