En el momento tenemos un aplicativo con 187 modulos, al momento de realizar la asignacion de permisos todo funciona correctamente, luego de hacer el guardado, notamos que solo se guardan alrededor de 120 modulos con permisos, a los faltantes no se les asigna ningun permiso.
Quedo atento a sus respuestas.
Antes de más, me parece que puede haber algun error de diseño de base de datos, no me parece un buen camino utilizar 187 modulos. Seguro que tienen cosas en comun unos con los otros, no? Entonces debrian integrarse algunas partes en modulos comunes.
Pero puedes empezar por conslutar tu log para ver si hay algun problema de falta de memoria, por ejemplo.
Hay que ver dos:
suitecrm.log
php_errors.log (puede tener otro nombre - es tu log de web server, configurado en php.ini)